The posting
Tytuł Programu/Projektu NCN OPUS 24 Celowana inhibicja szlaku hypuzynacji Opis Programu/Projektu Hypuzynacja to modyfikacja opisana tylko i wyłącznie dla jednego białka: eukariotycznego czynnika translacyjnego eIF5A i w procesie tym wykorzystywana jest poliamina: spermidyna. W pierwszym etapie hypuzynacji enzym syntaza deoksyhypuzyny (DHS) przyłącza 4-aminobutylowe ugrupowanie spermidyny do lizyny obecnej w eIF5A, co powoduje tworzenie się niestandardowej reszty aminokwasowej: deoksyhypuzyny. Następnie deoksyhypuzyna jest modyfikowana do hypuzyny przez hydroksylazę deoksyhypuzyny (DOHH). eIF5A bierze udział w procesie translacji białek, a hypuzynacja lizyny jest niezbędna dla jego aktywności. eIF5A jest także zaangażowany w rozwój niektórych chorób, takich jak cukrzyca, niektóre rodzaje nowotworów czy malaria. Ponadto, hypuzynowany eIF5A promuje proliferację komórek. Obecnie wiele uwagi poświęca się molekularnemu mechanizmowi selektywnej kontroli translacji białek przez eIF5A. Aktywny eIF5A jest niezbędny do wzrostu guza nowotworowego, a hypuzynacja jest ściśle związana z agresywnością nowotworów. Ponadto, ekspresja drugiego wariantu eIF5A-2 jest cechą charakterystyczną wielu nowotworów. Co więcej, mutacje w białkach zaangażowanych w szlak hypuzynacji są przyczyną poważnych zaburzeń neurologicznych. Dotychczas brakuje związków chemicznych umożliwiających specyficzną modulację szlaku hypuzynacji, a zależność struktura aktywność obecnie stosowanych inhibitorów nie jest jasno określona, gdyż istnieją poważne obawy co do specyficzności obecnie stosowanych cząsteczek. W związku z powyższym, głównym celem proponowanego projektu jest uzyskanie związków wiodących (ang. lead compounds) selektywnie modulujących szlak hypuzynacji, które mogą być dalej optymalizowane jako proleki lub związki narzędziowe, do wykorzystania w diagnostyce i leczeniu klinicznym. W niniejszym projekcie planujemy przekształcić małe cząsteczki uzyskane w naszych poprzednich badaniach w nowe związki wiodące, które mogą służyć jako cząsteczki będące prekursorami leków. Cząsteczki te zostaną dokładnie przebadane pod kątem aktywności, jak również rozwiążemy struktury krystaliczne DHS w kompleksach z opracowanymi związkami. Ponadto, wykorzystując wysokoprzepustowe badania krystalograficzne, odkryjemy nowe niskocząsteczkowe związki wiążące DOHH, które utorują drogę do syntezy nowych inhibitorów i w ten sposób, wraz ze związkami oddziałującymi z DHS, uzupełnią kolekcję modulatorów szlaku hypuzynacji. Dodatkowo, wykorzystamy wielopłaszczyznową strategię i przetestujemy nie tylko małe związki chemiczne, ale także aptamery oparte na kwasach nukleinowych jako możliwe modulatory hypuzynacji.
Zakres obowiązków / Opis zadań wg Regulaminu Pracy UJ Załącznik nr 1 do Regulaminu pracy Uniwersytetu Jagiellońskiego Wzory zakresu zadań i obowiązków pracownika (K/M) UJ Zatrudniona osoba będzie odpowiedzialna za niezależną koordynację zadań, podejmowanie racjonalnych i logicznych decyzji w celu rozwiązywania problemów, wprowadzanie nowych technik i narzędzi. Najlepszy wybrany Kandydat (K/M) będzie zobligowany do nauki i optymalizacji w zakresie nowych metod z zakresu biologii strukturalnej, biochemii, biofizyki i chemii medycznej. Praca będzie obejmować optymalizację wybranych testów aktywności, przeprowadzanie eksperymentów opartych testach aktywności, projektowanie nowych inhibitorów, przygotowywania próbek do badań strukturalnych i przygotowywanie raportów. Oferujemy: stabilne zatrudnienie w oparciu o umowę o pracę, w uznanej uczelni, współpracę z interdyscyplinarnym środowiskiem naukowym reprezentowanym przez uznanych naukowców, wsparcie naukowe i możliwość podnoszenia kwalifikacji oraz rozwoju zawodowego, dostęp do infrastruktury badawczej, benefity w postaci m.in. Karty Multisport, zajęć sportowych, możliwość skorzystania z pakietów medycznych, ubezpieczenia grupowego, dodatkowe świadczenia socjalne.
wykształcenie - wyższe (w tym licencjat), kierunek: doktorat zawód - Nauczyciel akademicki – nauki ścisłe i przyrodnicze język obcy - angielski, w mowie: C2 - biegły, w piśmie: C2 - biegły Kryteria kwalifikacyjne Do konkursu mogą przystąpić osoby, które spełniają wymogi określone w art. 113, 116 ust. 2 pkt 3) ustawy z dnia 20 lipca 2018 r. Prawo o szkolnictwie wyższym i nauce oraz zgodnie z §165 Statutu UJ odpowiadają następującym kryteriom kwalifikacyjnym: posiadają co najmniej stopień doktora; posiadają odpowiedni dorobek naukowy; biorą czynny udział w życiu naukowym. Dodatkowe kryteria niezbędne do zatrudnienia (wskazane wg hierarchii ważności) Idealni Kandydaci (K/M): mają odpowiedni dorobek naukowy z zakresu biologii strukturalnej, biochemii, biologii molekularnej lub chemii, posiadają przynajmniej jedną oryginalną publikację naukową, w której są wiodącym autorem, biorą czynny udział w życiu naukowym przejawiający się w szczególności w wystąpieniach na konferencjach i sympozjach, spełniają wymogi NCN odnośnie do osób zatrudnianych w projektach badawczych https://www.ncn.gov.pl/sites/default/files/pliki/uchwaly-rady/2022/uchwala60_2022-zal1.pdf#page=52, ponadto oczekuje się, że Kandydaci (K/M) będą posiadali wcześniejszą wiedzę i doświadczenie przynajmniej w jednej z wymienionych metod: doświadczenie w badaniach z zakresu biologii strukturalnej (krystalografia lub cryo-EM), biochemii, biofizyki, badania interakcji międzybiałkowych, projektowania leków, technik screeningowych, biologii molekularnej, biofizyki oraz zagadnień pokrewnych.
Idealny Kandydat (K/M) będzie posiadał: znajomość technik oczyszczania rekombinowanych i natywnych białek, znajomość metod biologii molekularnej, np. klonowanie, projektowanie konstruktów ekspresyjnych, Western blot, RT-PCR, znajomość prokariotycznych i eukariotycznych systemów ekspresji białek, doświadczenie w badaniu aktywności białek przy użyciu różnorodnych testów enzymatycznych, doświadczenie w analizie struktur makromolekuł, doświadczenie w pomiarach synchrotronowych lub cryoEM, doświadczenie z metodami SPR, HPLC, MST, znajomość języka angielskiego w stopniu komunikatywnym, umożliwiającym codzienną pracę w międzynarodowym środowisku naukowym, prezentację wyników oraz przygotowywanie artykułów naukowych, znajomość podstawowych programów pakietu MS Office oraz opcjonalnie środowiska systemu operacyjnego Linux oraz oprogramowania CCP4, Phenix, Relion, CryoSPARC, PanDDa, PyMol, GraphPad/Origin.
